배추 유전체정보 DB로부터 병저항성 관련 정보를 수집하고, 병저항성 배추 8개 품종(지부, Super CR 등)의 염기서열 다형성 분석을 통해 8,000개의 병저항성 관련 SNP 후보마커를 선발하였다. 이 염기서열과 다른 배추속 작물의 유전체 정보를 비교분석하여 무, 양배추에 활용 가능한 SNP 마커를 선발하였고, 이를 이용해 저항성과 이병성 품종으로 분석을 실시하여 무 위황병 및 양배추 뿌리혹병 연관 SNP 마커를 개발하였다.
배추 병저항성 관련 SNP 마커 중 무에서 활용 가능한 SNP 234개로부터 HRM 분석이 가능한 70개 SNP 마커를 선발하였고, 무 위황병 저항성과 이병성 3계통에서 차이를 보이는 ‘Radish-HRM2268’ 등 3개의 SNP 마커를 선발하였다. 배추 병저항성 관련 SNP 마커 중 양배추에서 활용 가능한 SNP 425개로부터 HRM 분석이 가능한 123개 SNP 마커를 선발하였고, 양배추 뿌리혹병 저항성 3계통과 이병성 3계통 간의 차이를 보이는 ‘BRS6’ 등 4개의 SNP 마커를 선발하였다.
배추 유전체정보와 병저항성 배추 8개 품종의 염기서열 다형성 분석을 통해 얻어진 8,000개의 병저항성 관련 SNP 후보마커로부터 무와 양배추의 병저항성 관련 분자마커를 개발한 기술은 배추 속의 다른 종, 작물에도 활용 가능한 새로운 육종기술이다.
또한 기존의 유전자 연관 마커보다 유전체를 기반으로 하는 대량 유전자형 분석이 가능한 분자마커 개발로 신속하게 맞춤형 품종 육성도 가능하게 할 수 있는 기술이다.
■원예특작과학원 채소과 농업연구관 김도선
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